31 agosto 2012

¿Combustible bacteriano para tu coche?

Publicado por Diego Armando viernes, agosto 31, 2012

Imagen de nicboo
Un grupo de trabajo del Instituto de Tecnología de Massachusetts, gracias a la manipulación genética, ha hecho de la bacteria Ralstonia eutropha una muy buena candidata para la producción de un biocombustible. 

R. eutropha es una bacteria oxidante del hidrógeno que puede vivir tanto de manera heterótrofa como autótrofa, ya se en condiciones aeróbicas o anaeróbicas, en agua o en tierra. Cuando crece de forma autótrofa, es capaz de fijar CO2 a través de la ruta de las pentosas. Es capaz de producir, por medio de la una fuente de carbono en exceso, poliésteres naturales conocidos como polihidroxialcanoatos, que se almacenan en el interior celular como reserva. 

Uno de los poliésteres naturales producidos por R. eutropha es el polihidroxibutirato (PHB). Experimentando con varias cepas, mediante la eliminación de algunos genes involucrados en la producción de PHB y la integración de un operón sintético para la producción de isobutanol, el equipo de trabajo logró redirecionar el exceso de carbón (en forma de CO2) en la síntesis de PHB hacia la creación de isobutanol y 3-metil-1-butanol. Estos alcoholes, aseguran los autores, pueden sustituir diréctamente los combustibles fósiles y pueden ser empleados con la infraestructura actual. Al principio lograron obtener una cepa que producía poco más de 180 mg de producto por litro. Después de la eliminación de otros genes (involucrados en el aprovechamiento de carbono en otros procesos), la producción aumentó a 270 mg/L de isobutanol y 40 mg/L de 3-metil-1-butanol. Mediante cultivo semicontinuo lograron disminuir la toxicidad causada por el isobutanol, y al final las bacterias produjeron más de 14 g/L de los alcoholes en un lapso de 50 días.

Ahora, los investigadores tienen como objetivo la optimización del sistema para aumentar la velocidad de producción y el diseño de biorreactores para escalar el proceso a niveles industriales. A diferencia de otros sistemas en los cuales los microbios producen los compuestos químicos deseados dentro de sus células (como el caso del PHB) y tienen que ser destruidos para obtener el producto, R. eutropha expele naturalmente los biocombustibles hacia el medio de cultivo, donde pueden ser filtrados de forma continua sin tener que parar la producción. Además, los investigadores destacan que, con modificaciones ligeramente diferentes del mismo microbio, se podría también convertir casi cualquier fuente de carbono, incluidos los desperdicios agrícolas o desechos municipales, en combustible útil.

Puedes leer el resumen del artículo original aquí.

27 agosto 2012

Genoma secuenciado del icónico pinzón de Darwin

Publicado por MARCOMEJÍA lunes, agosto 27, 2012
Imagen tomada de Sciencedaily.com

Científicos han secuenciado el genoma de uno de los pinzones de las Galápagos descritos por primera vez por Charles Darwin. El genoma del pinzón terrestre mediano (Geospiza fortis) es uno de los primeros de una serie de 100 genomas de especies de vertebrados que se planea sean secuenciados y publicados por una colaboración internacional entre el proyecto Genome 10K y BGI.
El genoma de este pinzón, el primero de la colaboración BGI-Genoma 10K que se facilitará a través de la UCSC Genome Browser, representa un avance científico simbólico, de acuerdo a Erich Jarvis, profesor asociado de la Duke University, quien estudia la neurobiología del aprendizaje vocal en las aves cantoras.
"El avance científico", dijo Jarvis, "es que nos permitirá investigar los genomas de un grupo de especies estrechamente relacionadas con una cantidad significativa de la diversidad en una población de la isla, lo que nos permite entender potencialmente mejor la genética de la evolución de sus rasgos."

Jarvis agregó: "Es simbólico porque fue la diversidad de fenotipos en estos pinzones lo que contribuyó a la teoría de Darwin sobre evolución."
En lo endémico de los bosques secos tropicales o subtropicales y matorrales de las Islas Galápagos, provoca que estas especies evolucionen rápidamente en respuesta a los cambios ambientales.
Goujie Zhang, director asociado de investigación del  BGI's dijo: "Estos pinzones son de gran importancia histórica, pues cuando Darwin estudió primero estas aves, es poco probable que haya imaginado cómo esta especie se convertiría en un modelo perfecto para estudiar la evolución en acción".
Zhang dijo: "Tener la referencia del genoma de esta especie ha abierto la puerta para la realización de estudios que puede mirar en tiempo real  los cambios evolutivos a nivel genómico de todas estas especies enigmáticas".

Jarvis dijo que este nuevo genoma nos ayudará a entender la evolución del aprendizaje vocal, "La disponibilidad de Geospiza fortis nos permitirá validar los resultados hasta el momento sólo se encuentran en el genoma del pinzón cebra".

Jarvis dijo que estos incluyen genes con mutaciones positivamente seleccionadas involucradas con el aprendizaje vocal en los pinzonesy también con el comportamiento necesario para la lengua oral e los sere humanos.

Jarvis agregó que el pinzón terrestre mediano cuenta con varios tipos de canciones, mientras que el pinzón cebra “es una de las especies más estereotipadas en el aprendizaje vocal”. Se espera que esta diferencia esté bajo control genético.  

La nota original se puede encontrar en la siguiente liga.

El artículo original se puede hallar en la sigueinte liga


Pingüino de Magallanes y cromosomas

Publicado por LUCERO LEÓN RANGEL lunes, agosto 27, 2012
¿Cuantos cromosomas tiene el pingüino de Magallanes? fue la pregunta que se hicieron Mario Ledesma y otros investigadores de la Universidad Nacional de Misiones, Argentina y de la Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Brasil, y para responder esto, obtuvieron sangre periférica de tres hembras y cuatro machos de esta especie de pingüno y analizaron 30 metafases, en las cuales determinaron que el número cromosómico es 2n=68 cromosomas, determinaron además que los pares 1º, 2º, 4º, 5º y 7º son submetacéntricos, los pares 6º y 10º metacéntricos, los pares 3º, 8º y 9º telocéntricos, y los restantes son cromosomas telocéntricos pequeños. Los cromosomas sexuales Z y W son submetacéntricos, si quieres leer el artículo completo consulta aquí.

22 agosto 2012

Descubren una causa genética para algunos casos de autismo

Publicado por Diego Armando miércoles, agosto 22, 2012
Imagen tomda de definicionabc


El autismo es un síndrome congénito (salvo contadas excepciones), que tiene un impacto en la comunicación y relaciones sociales de los individuos que lo presentan. Se sabe que este síndrome no tiene una única vía de desarrollo, y ya se han señalado varios genes y factores ambientales que podrían estar involucrados en su desarrollo.

Un grupo de científicos de la Universidad Davis de California, reportaron en una publicación el 14 de Agosto pasado, un mecanismo genético que podría desencadenar este tipo de comportamiento neurológico.

En su experimento con ratones, removieron un alelo del gen PTEN, que codifica para la proteína homóloga de fosfatasa y tensina (Pten por sus siglas en inglés), de las neuronas de los roedores, causando un déficit en su expresión. Investigaciones anteriores habían demostrado ya que este gen se encuentra en forma anormal en algunos niños con autismo, pero su efecto en el cerebro no era bien conocido. Este nuevo estudio muestra que una deficiencia en este gen provoca una interrupción en la utilización de energía en las neuronas de los ratones, debido a que afecta el funcionamiento de las mitocondrias, y por ende en el suministro de energía de las células

La proteína Pten es una supresora de tumores, y en varios casos de cánceres humanos, se ha encontrado que dicha proteína presenta mutaciones. Mientas que la pérdida de los dos alelos parece relevante para la formación de tumores, mutaciones en algún alelo han sido ligadas con tumores benignos, macrocefalia, ataxia, retraso mental, Alzheimer y autismo. Esta nueva investigación demuestra que cuando la proteína es insuficiente, su interacción con p53 genera deficiencias y defectos en otras proteínas que también se han encontrado en pacientes con problemas de aprendizaje, incluyendo autismo.

Los científicos detectaron un mal funcionamiento en las miticondrias neuronales de los ratones cuando tenían éstos apenas cuatro o seis semanas de nacidos. Entre las 20 y 29 semanas, el daño en el DNA de las mitocondrias y la interrupción de su función se había incementado dramáticamente. Por ese tiempo, los ratones comenzaron a evitar el contacto con sus compañeros en la camada y empezaron a pasar mucho tiempo aseándose. El comportamiento antisocial fue más pronunciado en los ratones a una edad equivalente en humanos a la pubertad, cuando la esquizofrenia y otros desórdenes mentales comienzan a ser más aparentes. Los ratones en el control, sin déficit de proteína Pten, no mostraron problemas con sus mitocondrias ni comportamiento anormal.

Estos descubrimientos pueden ser el comienzo del tratamiento del autismo, al menos en los casos en los cuales el gen PTEN esté involucrado.

Si quieres leer el artículo original, puedes dar click aquí.

21 agosto 2012

Ejercicio del tema Probabilidad y Genética

Publicado por Nitxin martes, agosto 21, 2012

Para practicar el tema de probabilidad y Genética, les proponemos resolver uno de los ejercicios propuestos por el Dr. Cristian Araneda de la Universidad de Chile y colaborador de Ciber-Genética.

Suponga que cruza 10 vaquillas sin cuernos (Cc) con un toro con cuernos (cc) ¿Cuál sería la probabilidad de tener 7 crías con cuernos y 3 sin cuernos?

Recuerda:

20 agosto 2012

Proteoma del maíz.

Publicado por LUCERO LEÓN RANGEL lunes, agosto 20, 2012

El viaje para indagar la regulación de la germinación del maíz mexicano inició, para Tzvetanka Dimitrova Dinkova, de la Facultad de Química (FQ) de la UNAM, hace 17 años, en el Departamento de Bioquímica, bajo la tutela de Estela Sánchez Quintanar. La etapa de cosecha ha arrojado los primeros resultados.

Al ofrecer la conferencia El proteoma durante la germinación de maíz: un enfoque a través del estudio de complejos traduccionales, en el Auditorio A de la FQ, Dimitrova detalló que los mecanismos de regulación de la síntesis de proteínas son cruciales para los procesos de desarrollo y diferenciación celular, así como para la respuesta al estrés ambiental y a la infección por patógenos.

Este proyecto pretende descubrir novedosos mecanismos moleculares que regulen la germinación de maíz; el proceso es requerido para el establecimiento de la plántula, y su éxito depende en gran medida de la síntesis de proteínas, basada en mensajes que ya vienen almacenados en la semilla.

Ya en su tesis doctoral, denominada Regulación de la expresión y actividad de los factores de iniciación de la traducción eIF4E y eIFiso4E durante la germinación de maíz, Dimitrova Dinkova había señalado que la aportación fundamental se basaba en la demostración de un mecanismo novedoso para regular la actividad y expresión de uno de los factores más importantes (eIF4E) en el proceso de síntesis de proteínas.

Mejoramiento agrícola

Tras la conferencia, enmarcada en los Seminarios Académicos de la Facultad de Química, la universitaria señaló que el cierre de la investigación fue realizado por un estudiante de doctorado de su equipo.

Se logró identificar un grupo de proteínas involucradas en la germinación exitosa de la semilla de maíz, y nos permitió contribuir al análisis de más variedades o líneas para comprobar el papel de los complejos traduccionales en más de una variedad.

El estudio podría ser aplicado en el mejoramiento agrícola, para que el cereal mexicano no sea desplazado por variedades de otros países, apuntó.

Además de que nuestro maíz es muy bonito y diverso, este paso es fundamental porque permitirá desarrollar herramientas que garanticen el éxito de las variedades de interés agronómico nacional, sin ser desplazadas por otras cuyas propiedades no son idóneas para los fines de consumo en el país, como para la elaboración de tortillas y de otros alimentos”, finalizó.

Texto tomado del Boletín UNAM, puedes leer el original aquí.

18 agosto 2012

Replicación del DNA VIDEO

Publicado por LUCERO LEÓN RANGEL sábado, agosto 18, 2012
A continuación podrán ver un video de la replicaicón del DNA.



Probabilidad y Genética

Publicado por Ciber-Genética sábado, agosto 18, 2012
A continuación les ofrecemos dos presentaciones relativas al tema de Genética y probabilidad que pensamos les serán útiles.

14 agosto 2012

Gen clave que funciona contra la muerte celular es descubierto

Publicado por MARCOMEJÍA martes, agosto 14, 2012
imagen tomada de http://wakeup-world.com
 
Un equipo de investigadores del Instituto de Genética Médica de la MedUni Vienna's ha descubierto que dos genes (TSC/Tuberin and PRAS40) son reguladores extremadamente importantes en el desarrollo de las células madre:  si estos genes están desactivados, las células madre no se desarrollan sino que sufren muerte celular programada.
El grupo dirigido por Markus Hengstschläger, Director del Instituto de Genética Médica de la MedUni Vienna's ha sido capaz de demostrar en un artículo ya publicado en la revista Human Molecular Genetics, que las células madre necesitan tanto de estas proteínas para desarrollar y participar en la regeneración y procesos de diferenciación en las células.
El cuerpo humano mantiene un equilibrio estable entre la muerte celular y la descomposición de los tejidos y la regeneración del tejido de las células madre. Las células madre tienen el potencial de convertirse en otros tipos de células, tales como piel, músculo o células nerviosas y, por tanto, son cruciales para la reconstrucción de los tejidos. Una célula del estómago humano, por ejemplo, vive solamente dos días. Las células de la piel viven hasta cuatro semanas. Una célula de pulmón muere después de cerca de 80 días y un glóbulo rojo muere después de cerca de 120 días.
Las dos proteínas,  TSC (tuberina) y PRAS40 son cruciales para este desarrollo, para decidir si la célula madre se desarrolla correctamente o se somete a la apoptosis, una forma de muerte celular programada. Actúan, por así decirlo, como 'guardianes'.

En la siguiente liga se puede encontrar el artículo original, y en esta liga, la nota original.

13 agosto 2012

CALENDARIO DE ACTIVIDADES DEL GRUPO 5249

Publicado por Rosario lunes, agosto 13, 2012

Moscas vemos, genes no sabemos

Publicado por Diego Armando lunes, agosto 13, 2012

Científicos de la Universidad de Buffalo encontraron, incorporados en el genoma de diversas especies de moscas del género Drosophila, genes muy similares a los presentes en los virus  de la familia Rhabdoviridae del tipo sigma.

Los virus sigma pertenecen a una clase de virus con RNA (retrovirus), relacionados con los virus de la rabia y del ébola, y que causan parálisis a los dípteros, grupo al que infectan específicamente. Se ha encontrado que los  virus sigma se transmiten únicamente de forma vertical a través de espermatozoides y óvulos infectados. Otra de las peculiaridades de estos virus, es que que carecen de la enzima transcriptasa reversa, que permite convertir el RNA en DNA, para poder integrarse así en el genoma del hospedero. ¿Cómo entonces estos genes virales se integraron al DNA de las moscas? Este estudio sugiere que los virus pueden utilizar transcriptasas reversas presentes en las células hospederas para facilitar la incorporación de sus genes virales. 

El el genoma de una mosca, los investigadores encontraron un gen de virus sigma justo a mitad de un retrotransposon, una secuencia que produce una transcriptasa reversa con el propósito de hacer nuevas copias de sí mismo para introducirlas al genoma. La posición y contexto del gen viral sugiere que el retrotransposón hizo un error y copió y pegó los genes virales en el genoma de la mosca. Esta es la evidencia más clara, hasta la fecha, de que este tipo de RNA virus entren al genoma del huésped por acción de enzimas presentes ya en la célula infectada.

El descubrimiento también podría abrir la puerta para la investigación sobre por qué las moscas y otros organismos retienen selectivamente genes virales a través del curso evolutivo. Una hipótesis es que dichos genes proveen de una defensa anti-viral, pero debido a que la mayoría de los genes virales encontrados en animales son muy antiguos (millones de años), sus secuencias difieren significativamente de los virus modernos y esto dificulta la comprobación de esta hipótesis. Sin embargo, en este estudio descubrieron genes virales relativamente recientes, con material genético muy similar a los modernos virus sigma. Para encontrar si los genes similares a los de los virus sigma tienen una función antiviral en las moscas de la fruta, los científicos podrían introducir virus sigma modernos a las moscas que ya contienen los genes virales.  

Puedes consultar el Resumen (en inglés) del artículo original aquí

10 agosto 2012

Congreso Nacional de Genética 2012

Publicado por Nitxin viernes, agosto 10, 2012


Este año el Congreso Nacional de Genética se realizará en Mazatlán, Sinaloa los días 3, 4 y 5 de octubre del presente. Las actividades comprenderán: conferencias magistrales, ponencias orales, presentaciones en carteles, talleres simultáneos, Concurso de Carteles “Dr. Lino Díaz de León” y a la mejor tesis (con tres modalidades: licenciatura, maestría y doctorado). Puedes encontrar toda la información en la página:
http://smgac.org.mx/congreso2012.html

08 agosto 2012


Imagen tomada de: http://www.alamy.com/thumbs/6/%7BE6D38FA9-5FDB-413F-B268-F9D5750DE510%7D/AF60KF.jpg



En el año 1990, un grupo de científicos, que trabajaba en el Instituto  John Innes en  Norwich (Reino Unido), clonaron el gen  r (rugosus) del chícharo, que determina si la semilla es redonda o arrugada. Se ha demostrado que una isoforma de la "enzima de ramificación de almidón" (SBE I) está presente en las semillas redondas (RR o Rr), pero está ausente en las semillas arrugadas (rr). Por experimentos cuidadosamente planificados, se demostró que SBE I está situado en el locus r. También se demostró que, en líneas rr, el gen SBE está interrumpido por una secuencia de DNA pequeño (0,8 kilobases) llamado "inserción semejante a un transposón "transposon-like insertion". La interrupción del gen  SBE I mediante la inserción de una secuencia externa, conduce a una enzima aberrante que conlleva   a trastornos metabólicos en la biosíntesis de almidón, lípidos y proteínas. Esto resulta en un aumento de azúcares libres debido a la falta de formación de almidón. Esto probablemente conduce a una mayor presión osmótica y por lo tanto mayor contenido de agua en la célula y mayor tamaño en las células rr. Las semillas pierden gran parte de su volumen en la maduración que lo que conduce a la contracción de su volumen. La testa no se reduce con los cotiledones, por lo que las semillas se arrugan. 

Si quieres más información puedes leer el artículo:
The wrinkled-seed character of pea described by Mendel is caused by a transposon-like insertion in a gene encoding starch-branching enzyme

La versión en pdf se encuentra en la siguiente dirección: 

07 agosto 2012

Artículo de Mendel en español

Publicado por Nitxin martes, agosto 07, 2012
Imagen tomada de: http://2.bp.blogspot.com/-9mMZfGv-sZc/TsKIcTs0IAI/AAAAAAAAAA8/ELpucHejcHY/s1600/mendel.jpg 

 He aquí una versión en español del artículo de Mendel Leído en las reuniones del 8 de febrero y del 8 de marzo de 1865.

de 1865.

06 agosto 2012

Programa Genética I. Facultad de Ciencias. UAM

Publicado por Nitxin lunes, agosto 06, 2012

03 agosto 2012

¡Inscríbete al Taller Genes y Ambiente!

Publicado por Diego Armando viernes, agosto 03, 2012
Informes:
Laboratorio de Genética, Facultad de Ciencias
Teléfono 56224906
correo electrónico: rosario.rodriguez@ciencias.unam.mx


02 agosto 2012

ERRAR ES HUMANO (MEIÓTICAMENTE HABLANDO)

Publicado por LUCERO LEÓN RANGEL jueves, agosto 02, 2012

Las aneuploidías (trisomías y monosomías) son las anomalías cromosómicas más frecuentes en los seres humanos, aproximadamente el 5% de los embarazos presentan esta característica, la mayor parte de ellos muere antes de nacer, por lo cuál, esta se convierte en la primer causa genética de perdida de embarazo; sin embargo algunos individuos con aneuploidías nacen vivos, convirtiéndose así las anueploidías en la primer causa de retraso mental.
En el artículo de revisión titulado Errar (meióticamente) es humano: la génesis de la aneuploidía humana, publicado en la revista Nature por Terry Hassold y Patricia Hunt, se analizan los principales mecanismos que causan la no disyunción y por tanto las anueploidías.

Puedes leer el resumen de este artículo en el siguiente link

2° Olimpiada Universitaria del Conocimiento 2012

Publicado por Diego Armando jueves, agosto 02, 2012
Les traemos aquí la convocatoria para la 2° Olimpiada Universitaria del Conocimiento 2012 para Bachillerato.


Si quieres más información, visita la siguiente página: http://www.olimpiadas.unam.mx/



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