La genética de nuestras ancestras

La genética de nuestras ancestras: variantes protectoras en mujeres latinas frente al cáncer de mama

Hoy, en Cibergenética, estamos especialmente reflexivos. Hace apenas unas horas, tuvimos la oportunidad de asistir a una conferencia sumamente reveladora impartida por la Dra. Andrea Llera, de la "Fundación Instituto Leloir", en Buenos Aires, Argentina. La charla está enmarcada en los Seminarios de Actualización en Genética que organizamos un conjunto de profesores de la Facultad de Ciencias de la Universidad Nacional Autónoma de México (América Nitxin Castañeda Sortibrán, Claudia Segal Kischinevsky, Marco Antonio Carballo Ontiveros, María de Jesús Vázquez Cuevas y Edgar Mixcoha Hernández, puedes ver la conferencia aquí: https://www.youtube.com/watch?v=FHMCAvdZvDs). 

Tras el debate y los aprendizajes que nos dejó, decidimos sentarnos a poner por escrito lo que esto significa para nuestra labor de divulgación y para la medicina genómica en nuestra región.

El estudio de la diversidad genética humana no es solo una curiosidad científica; es una necesidad urgente. Durante años, la mayoría de los estudios de asociación del genoma completo (GWAS) se centraron casi exclusivamente en poblaciones de ascendencia europea. Sin embargo, la investigación en poblaciones diversas está revelando piezas clave que explican las disparidades en salud y abren nuevas vías de tratamiento.

El hallazgo en 6q25: una variante protectora. 

En 2014, un estudio clave marcó un antes y un después al identificar una variante genética significativa en la región 6q25, cerca del gen del receptor de estrógeno 1 (ESR1). Esta variante, llamada rs140068132, resultó ser un descubrimiento notable:

Efecto protector. El alelo menor de esta variante está fuertemente asociado con una disminución del riesgo de desarrollar cáncer de mama. Origen ancestral. A diferencia de muchas variantes reportadas en poblaciones europeas o asiáticas, esta variante es de origen indígena americano. Es relativamente común en poblaciones latinoamericanas, con una frecuencia que varía según la ancestría, pero es rara o inexistente en grupos de ascendencia europea o africana.

Protección diferencial: Como se observa en la tabla, aunque la variante es protectora en todos los casos, el efecto es particularmente pronunciado en los subtipos que involucran HER2 (tanto positivos como negativos en receptores hormonales), lo que sugiere que esta variante podría estar influyendo en vías biológicas que van más allá del simple receptor de estrógeno (ESR1).

El estudio en mujeres peruanas no solo replicó el hallazgo original de Fejerman et al. (2014) sobre el efecto protector general de la variante rs140068132, sino que también demostró que esta asociación se mantiene independiente de otras variantes genéticas en la misma región. La alta proporción de ancestría indígena americana en la población peruana estudiada (promedio del 77% en los pacientes) ha permitido identificar estos patrones específicos con mayor claridad, subrayando la importancia crítica de estudiar diversas poblaciones para completar el panorama genético de las enfermedades complejas

 El estudio (Zavala et al., 2022) no solo replicó la asociación protectora de la variante rs140068132, sino que profundizó en cómo esta actúa según el subtipo de cáncer: especificidad por subtipo: Se observó que la variante es más protectora frente a los tumores HER2-negativos que frente a otros subtipos. Esta protección es independiente de otros factores genéticos conocidos en la región. La ubicación de esta variante cerca del gen ESR1 sugiere que podría estar involucrada en la regulación transcripcional y afectar cómo las células cancerosas responden a señales hormonales.

¿Por qué esto es importante? 

"Entender por qué las mujeres latinas presentan diferentes riesgos y subtipos de cáncer de mama permite desarrollar mejores estrategias de prevención".

Estos resultados demuestran que las variantes genéticas no actúan de la misma manera en todas las poblaciones. La historia demográfica de Latinoamérica ha creado un mosaico genético único que requiere estudios específicamente diseñados para nuestra realidad. Aunque los GWAS identifican regiones, el reto actual es comprender cómo funcionan estas variantes. El hecho de que rs140068132 esté asociada con una menor densidad mamográfica sugiere que la genética puede moldear el tejido mamario de manera que confiere resistencia al tumor.

La genética de poblaciones es un campo complejo en el que cada detalle metodológico cuenta. El estudio de Zavala y colaboradores no solo nos ofrece resultados fascinantes, sino que también demuestra un rigor científico envidiable en su enfoque.

Para quienes están interesados en el "detrás de escena" de la ciencia, el artículo completo es una lectura obligatoria. En él podrán explorar cómo los autores utilizaron el análisis de componentes principales (PCA) y t-distributed stochastic neighbor embedding (t-SNE) para desentrañar la estructura genética de la población peruana. Aplicaron modelos de regresión logística multinomial y análisis condicionales para aislar el efecto de la variante rs140068132 frente a otras variantes en la región 6q25.

Por América Nitxin Castañeda Sortibrán, Marco Antonio Carballo Ontiveros y Zeltzin Muñoz Juárez (Facultad de Ciencias, UNAM).

A continuación, resumimos los datos clave de los artículos proporcionados para que los tengas a mano. Estos datos confirman que, si bien la variante es protectora en general, su impacto varía significativamente según el perfil molecular del tumor.

Fejerman, L., Ahmadiyeh, N., Hu, D., Huntsman, S., Beckman, K. B., Caswell, J. L., ... & Ziv, E. (2014). Genome-wide association study of breast cancer in Latinas identifies novel protective variants on 6q25. Nature communications, 5(1), 5260.

Zavala, V. A., Casavilca-Zambrano, S., Navarro-Vasquez, J., Castaneda, C. A., Valencia, G., Morante, Z., ... & Fejerman, L. (2022). Association between ancestry-specific 6q25 variants and breast cancer subtypes in Peruvian women. Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention, 31(8), 1602-1609.

Te invitamos a ver el video:

Categories: